Реакции переаминирования. Роль в биосинтезе аминокислот
Чаще всего в трансаминировании участвуют аминокислоты и кетокислоты, которых много в организме — глутамат, аланин, аспарагиновая кислота, α-кетоглутарат, ПВК и ЩУК. Основным донором аминогруппы служит глутамин, а кетогруппы - α-кетоглутарат. Распространёнными аминотрансферазами в большинстве тканей млекопитающих являются аланинаминотрансфераза (АЛТ) и аспартатаминотрансфераза (ACT).
Реакции трансаминирования обеспечивают синтез и распад амино- и кетокислот, перераспределение аминного азота в тканях организма.
На реакции аминирования основан синтез аминокислот.
Макроэргические соединения. Метаболическая роль.
Роль макроэргический соединений: изменение константы равновесия реакции (энергии Гиббса) за счёт сопряжения, вследствие того что энергия Гиббса гидролиза (или другой реакции) макроэргического соединения сильно отрицательная (самопроизвольный процесс). Сопряжение гидролиза макроэргического соединения с несамопроизвольной реакцией делает её самопроизвольной. Гидролиз не совсем гидролиз а перенос фосфатной группы с АТФ на другое вещество и именно за счёт этого уменьшается энергия Гиббса.
Среди макроэргических соединений следует выделить наиболее важные нуклеотид три (моно, ди) фосфаты АТФ ГТФ ЦТФ ТТФ, Пирофосфат (два фосфата). Примеры самопроизвольных реакций. Гидролиз АцетилКоА
Гидролиз креатинфосфата
Гидролиз фосфоенолпирувата
Билет 7
Биосинтез пуриновых нуклеотидов
Синтез нуклеотидов может происходить двумя путями или синтезироваться заново или путём реутилизации. Откуда получаются части пурина.
Происхождение частей пуринового кольца в синтезе
Как видно из рисунка синтез начинается с аминирования 1 атома рибозы глутамином, далее рибоза фосфат обозначается R- и так далее по схеме.
Впоследствии из инозиата синтезируются аденилат (АМФ) и гуанилат (ГМФ), которые нужны для синтеза нуклеотидов, АТФ и др.
Пути преобразования инозината.
Отличительной особенностью синтеза пуриновых нуклеотидов является то, что синтез нуклеотида происходит на сахаре, в то время как у пиримидиновых нуклеотидов вначале синтезируется пиримидиновое кольцо.
Классификация ферментов.
Оксидредуктазы: систематические названия их составляют по форме «донор: акцептор оксидоредуктаза» лактат-НАД оксидредуктаза отнимает электрон и протон у лактата, реакции ОВР
Трансферазы: наименование их составляется по форме «донор: транспортируемая группа – трансфераза» ацетилтрансферазы, амино-трансферазы, фосфотрансферазы.
Гидролазы: наименование их составляют по форме «субстрат-гидролаза»
Лиазы: «субстрат-лиазы»
Изомеразы: «субстрат – цис-транс-изомераза». Если изомеризация включает внутримолекулярный перенос группы, фермент получает название «мутаза»
Лигаза: название их составляют по форме «X:Y лигаза», где X и Y обозначают исходные вещества. Глутамат:аммиак лигазу сокращенное название «глутаминсинтетаза»
Билет № 8
Биосинтез пиримидиновых нуклеотидов. (Синтез двуцепочечный, сначала основание, потом прифигачивается сахар. Синтез в митохондриях(?))
РRPP-фосфорибозилпирофосфат
Сначала синтез пиримидинового кольца (Оротат), далее к нему присоединяется рибоза
Исходный УМФ фосфорилируется до ди-, а затем трифосфата УТФ. Он, в свою очередь, превращается цитидинтрифосфат-синтазой (СТР-синтаза) в ЦТФ.
Ферменты. Общая характерстика. (Характеристика фермента в цифрах: что такое Vм, Kм, скорость, активность. Регуляция)
Реакция Михаэлиса-Ментона
Лимитирующей по скорости реакцией является распад фермент-субстратного комплекса с образованием продукта
Математическая модель
При алгебраическом преобразовании математической модели
Мы можем получить следующую кривую
под числом оборотов понимается,количество изменений конформации активного центра с образование продукта.
Субстратная специфичность ферментов
Кратко про аллостерическое активация и ингибирование
Билет № 9