Третье прошение об отставке.
По возвращении из путешествия, осенью 1842 года, Архиепископ Иосиф (Семашко) Высочайше назначен был членом Комитета по делам о раскольниках и отступниках от Православия.
Однако новое назначение мало утешало Архиепископа и 18 (31) декабря 1842 года Владыка вновь обратился на Высочайшее имя с прошением об увольнении на покой.
Прошение вновь не было удовлетворено, и Архиепископ Иосиф (Семашко) оставался на своем посту еще в течение долгих 25-ти лет!
Милости Государя и возвышение.
В 1842 году с Высочайшего одобрения Владыкой осуществлен был перевод Литовской кафедры из местечка Жировиц в г. Вильно, где оставалось наибольшее засилье польских католиков.
Архипастырю предстояла трудная задача – среди такой враждебной обстановки укреплять Православие как в г. Вильно, так и во всей епархии.
Первого (14) апреля 1847 года Архиепископ Иосиф (Семашко) Высочайше назначен был членом Святейшего Синода.
Заботясь о пастве.
Архипастырь продолжал с прежней энергией трудиться на благо своей паствы.
С одинаковым участием разделял Владыка и ее радости и горести. Радостно встречал он каждый новый случай присоединения к Православию, ликовал при освящении восстановленных православных храмов, т. к. это были плоды его неустанного труда.
Не оставлял Архипастырь своей паствы и в трудностях. Он поддерживал дух бодрости в период эпидемии холеры, в голодные годы организовал раздачу хлеба всем нуждавшимся без различия вероисповедания.
Бедных не забывал Владыка никогда. При всех знаменательных случаях в жизни Архипастырь делал большие пожертвования в пользу бедных.
Переселившись в 1844 году из Санкт-Петербурга в Жировицы к одноименной чудотворной иконе Божией Матери, Владыка исходатайствовал учреждение второго Ковенского викариатства в Литовской епархии; перевел в г. Вильно Литовское епархиальное управление, вместе с Семинарией; хлопотал об усилении православно-русского элемента в западнорусском чиновничестве, в виду возможности нового польского мятежа; противодействовал введению в приходские школы изучения польского и жмудского языков; открыл свыше 200 церковно-приходских школ и других училищ.
В бытность Графа Михаила Николаевича Муравьева (1796-1866) Виленским генерал-губернатором Архиепископ Иосиф (Семашко) оказал материальную поддержку духовенству, пострадавшему во время очередного польского мятежа 1863 года, восстановил и вновь построил несколько церквей.
Однако в своей целенаправленной деятельности Архиепископ Иосиф (Семашко) иногда не находил поддержки со стороны гражданской власти. Такие случаи приводили его к глубокой сердечной печали и желанию уйти на покой.
Последнее прошение.
Такой факт, к примеру, имел место в 1851 году, когда 30 октября (12 ноября) Владыка вновь подал прошение на Высочайшее имя об увольнении на покой.
Однако и в этот раз прошение не было удовлетворено Императором, поскольку по мнению Государя, Владыка мог и должен был принести большую пользу Русской Православной Церкви, Отечеству, а также воссоединенному духовенству и пастве.
В чине Митрополита.
30 марта (12 апреля) 1852 года 53-летний Архиепископ Иосиф (Семашко) Высочайше возведен был в чин Митрополита.
Столь высокий церковный чин обязывал его к еще большему подвигу на поприще духовного и нравственного просвещения. Мудрый и заботливый Архипастырь постепенно, но настойчиво уничтожал остатки латинства, уцелевшие среди воссоединенной паствы.
Период времени с 1854 по 1861 гг. оказался сравнительно спокойным в жизни Митрополита Иосифа (Семашко), а потому основное внимание уделено было им благоустройству епархии и охранению паствы от не прекращавшейся латино-польской пропаганды.
За это время Владыкой построено было новое здание Консистории (1854), осуществлена капитальная перестройка Архиерейского дома (1856), обновлен иконостас Пещерной церкви и начато строительство 36 небольших церквей; улучшено здание духовного училища; открыто 222 приходских училищ с 2700 учениками и учреждено первое женское училище (1860).
30 января (12 февраля) 1858 года Митрополит Иосиф (Семашко) избран был почетным членом Санкт-Петербургской Императорской Академии наук.
В августе 1859 года Высокопреосвященный Иосиф (Семашко) вызван был в Санкт-Петербург для присутствия в Святейшем Синоде, но вскоре из-за плохого состояния здоровья вынужден вернуться в г. Вильно.
Высочайшая награда.
В День своего Тезоименитства 30 августа (12 сентября) 1856 года Государь Император Александр II Николаевич (1818-1881) Высочайше пожаловал 56-летнему Митрополиту Иосифу (Семашко) – первому Митрополиту Литовскому и Виленскому за понесенные труды на благо Церкви и Отечества Императорский орден Святого Апостола Андрея Первозванного.
То было первое дарование высшей награды Российской Империи Русскому Архиерею в Царствование Государя Императора Александра II «Освободителя» и единственное в ряду последующих Митрополитов Литовских и Виленских.
Никто более не сделал для западного края России столько славного и вероучительного, как Митрополит Иосиф (Семашко).
Усмиритель мятежа.
Последние годы жизни Митрополита Иосифа (Семашко) связаны были с бурными событиями, возникшими на западе Российской Империи.
Недовольная происшедшими в западном крае преобразованиями еврейско-латино-польская партия при поддержке давних врагов нашей Родины – Франции и Великобритании, вновь организовала в 1863 году в Царстве Польском вооруженный мятеж.
Митрополит Иосиф (Семашко), несмотря на усилившуюся в это время болезнь, не отлучался никуда из города, совершая богослужения в храмах, поддерживал дух бодрости и уверенности в подавлении мятежа и смуты в духовенстве и народе.
1863-й год стал годом испытания для юной Литовской паствы, и она, возглавляемая своим мудрым Архипастырем, достойно выдержала посланное Богом испытание, выйдя из него победительницей.
Последние годы.
После усмирения мятежа много отрадного для Митрополита Иосифа произошло в западном крае, осуществились многие его предначертания.
Первого (14) января 1864 года стал издаваться на русском языке журнал "Виленский вестник", впервые открылась Русская книжная торговля.
Каждый день в местной печати сообщались сведения то о возобновлении древних церквей, то о закладке и освящении новых, то об обращении костелов в православные храмы, то о возвращении целых приходов в Православие. Во всех этих делах принимал большее или меньшее участие Митрополит Иосиф (Семашко).
В 1867 году по его распоряжению в епархии была учреждена 41 церковная библиотека. В то же время здоровье Владыки решительно ухудшалось.
Недуг Владыки.
С 1867 года Митрополит Иосиф (Семашко) сам почти не совершал богослужений, но и тогда все епархиальные дела находились под его строгим управлением.
Архипастырь был осведомлен обо всех событиях обширной епархии, ежедневно принимал представителей епархиального и духовно-учебного ведомства, на всех делах секретарь писал резолюции под его диктовку.
Несмотря на телесные немощи, Митрополит Иосиф (Семашко) до последних дней жизни отличался бодростью духа и ясностью мысли. Однако болезнь продолжала подтачивать его силы.