Определение белка спектрофотометрическим методом
Спектрофотометрический метод количественного определения белка основан на способности ароматических аминокислот (триптофана и тирозина) поглощать ультрафиолетовый свет с максимумом поглощения при 280 нм. Таким образом, измеряя величину оптической плотности при этой длине волны, можно судить о количестве белка, присутствующего в данном растворе.
Определению белка данным методом мешает присутствие нуклеиновых кислот. Их влияние можно исключить, измеряя оптическую плотность не только при 280 нм, но и при 260 нм, а затем рассчитать истинное содержантие белка по номограмме (см. Г.А. Кочетов «Практическое руководство по энаимологии». – С. 227).
Спектрофотометрический метод является в некоторой степени приближенным, так как количество триптофана и тирозина у разных белков различно. Поэтому поглощение одинакового количества разных белков неодинаково. Условно можно считать, что при концентрации «усредненного» белка в растворе, равной 1 мг/мл, величина оптической плотности при 280 нм равна 1,0 (при использовании спектрофотометрической кюветы толщиной 1 см).
Несмотря на недостаточную точность, спектрофотометрический метод применяется очень широко: он быстрый, не требует каких-либо реагентов, раствор белка после измерения может быть использован для дальнейшей работы.
Реактивы и оборудовние
· Спектрофотометр СФ-16.
· Пробирки, пипетки.
· Сыворотка.
Ход работы
- Включить спектрофотометр в сеть.
- Поставить зеркало в блоке источника света в положение «Д».
- В блоке стабилизатора поставить переключатель ламп в положение «Лампа дейтериевая».
- В блоке спектрофотометра поставить переключатель фотоэлемента в положение «Ф».
- Тумблер включения спектрофотометра поставить в положение «Накал».
- Нажать кнопку «Высокое напряжение» и оставить спектрофотометр на 20-30 минут прогреваться.
- Развести сыворотку в 200 раз (в мерную колбу на 100 млвнести 0,5 мл сыворотки и довести дистиллированной водой до метки).
- Установить длину волны 280 нм.
- Установить измерительную шкалу на «0», переключатель шкал поставить на «0-100», переключатели темнового тока и чувствительности – на «1», а ручку плавной регулировки чувствительности – в центральное положение.
- Открыть крышку кюветной камеры, в ячейку «1» кюветодержателя поставить кювету с контролем (дистиллированной водой), а в ячейку «3» - кювету с исследуемым образцом, закрыть крышку кюветной камеры. ВНИМАНИЕ! Крышку кюветной камеры можно открывать только тогда, когда рукоятка переключателя шторки фотоэлемента находится в положении «Закр».
- Поставить против окошка фотоэлемента ячейку «1». Вращая рукоятку плавной регулировки темнового тока, скомпенсировать темновой ток фотоэлемента (установить стрелку миллиамперметра на центральный штрих шкалы).
- Открыть фотоэлемент, поставив рукоятку шторки переключателя в положение «Откр». Вращая рукоятку механизма изменения ширины щели, установить стрелку миллиамперметра на центральный штрих шкалы. Закрыть фотоэлемент.
- Поставить против окошка фотоэлемента ячейку «3», открыть фотоэлемент. Установить стрелку миллиамперметра на центральный штрих шкалы, поворачивая движок отсчётного потенциометра. Закрыть фотоэлемент.
- Снять отсчёт по шкале оптической плотности D (верхняя).
- Рассчитать концентрацию белка в сыворотке по формуле 200*D (мг белка в мл сыворотки).и сравнить её с концентрацией белка, определённой методом Лоури.
Оптическая плотность равна:
Концентрация белка в сыворотке равна:
Контрольные вопросы
1. Принцип устройства спектрофотометра.
2. Какие из известных Вам биомолекулы можно количественно определять используя спектрофотометр не прибегая при этом к их предварительной модификации.
3. Перечислите преимущества использования спектрофотометра в биохимических исследованиях по сравнению с фотоэлектроколориметром.
Лабораторная работа №4
ГЕЛЬ-ФИЛЬТРАЦИЯ
Для проведения гель-фильтрации используются гели, состоящие из гранул, в которых имеются поры определённого размера. В качестве матриц для гель-фильтрации наиболее широко используются сефадексы, биогели, трисакрилы, ультрагели. Метод основан на разнице размеров молекул белков и диаметра пор матрицы. Крупные молекулы, размеры которых превышают размеры пор, не проникают в гранулы и движутся быстрее мелких молекул, которые проникают в гранулы. Молекулы промежуточного размера проникают только в часть пор и поэтому двигаются с промежуточной скоростью. В результате молекулы элюируются из колонки вы порядке уменьшения их размеров. Прокалибровав колонку с помощью белков с известной молекулярной массой, можно определить молекулярные массы исследуемых белков. Гель-фильтрация широко используется для разделения белковых смесей, определения молекулярной массы, удаления солей (обессаливания), смены буфера.
Реактивы и оборудование.
· Сефадекс G-75.
· Раствор NaCl (9 г NaCl на 1000 мл H2O).
· Раствор гемоглобина (2 мг/мл) и рибофлавина (0,5 мг/мл).
· Колонка для гель-фильтрации (8x150 мм).
· Фотоэлектроколориметр КФК-2.
· Стаканы, пробирки, стеклянные палочки, пипетки, фитинги.
Ход работы
1. Приготовление геля
Сефадекс G-75 суспендируют в 5-10 кратном объёме дистиллированной воды и оставляют для набухания на 3 часа. Затем перемешивают до однородной массы, дают отстояться. После оседания основной массы геля осторожно декантируют надосадочную жидкость с неосевшими обломками гранул. Суспендирование и последующую декантацию (отмучивание) повторяют 3-4 раза. Отмучивание геля уменьшает сопротивление колонки потоку растворителя, что приводит к увеличению скорости элюции.
2. Заполнение колонки
Колонку закрепляют в вертикальном положении, закрывают нижний конец пробкой со вставленным фитингом, помещают в основание колонки кружок фильтровальной бумаги, размер которого должен точно соответствовать внутреннему размеру колонки. Заливают примерно 2 мл раствора NaCl, дают заполниться фитингу и через воронку по стенке заливают густую суспензию геля. Открывают зажим колонки и дают раствору свободно вытекать, следя за тем, чтобы над гелем оставался слой раствора NaCl. Суспензию геля прибавляют до тех пор, пока его высота в колонке не достигнет нужного уровня, верхняя поверхность геля (стартовая зона) должна быть строго горизонтальной. Затем на поверхность геля помещают кружок фильтровальной бумаги, не допуская образования воздушных пузырей. Колонку промывают (уравновешивают) 1 объёмом NaCl.
3. Разделение гемоглобина и рибофлавина.
Открывают зажим колонки и сливают столб раствора NaCl, находящийся над сефадексом. Когда нижний мениск раствора коснётся поверхности кружка фильтровальной бумаги, колонку закрывают. Осторожно с помощью шприца наносят 0,5 мл раствора гемоглобина и рибофлавина. Открывают колонку, дают образцу впитаться и затем быстро смывают остатки образца со стенок колонки тем же объёмом растворителя. Затем заполняют колонку раствором NaC, закрывают верхней пробкой с иглой и посоединяют фитингом к сосуду, из которого поступает элюирующий раствор. С момента нанесения образца на колонку собирают фракции объёмом 1 мл. Через некоторе время гемоглобин и рибофлавин разделяются на 2 зоны. Нижняя – гемоглобин движется быстрее, верхняя – рибофлавин – медленнее. Элюирование проводят до полного выхода рибофлавина. Определяют элюционный объём (Vэ) гемоглобина (Vэг) и рибофлавина (Vэр).
Для этого измеряют оптическую плотность элюата на КФК-2 при длине волны 540 нм для гемоглобина и 440 нм для рибофлавина, и складывают объёмы всех фракций, вышедших до максимума поглощения при 540 нм (для гемоглобина) и 440 нм (для рибофлавина).
Содержание отчёта
1.Полученные результаты оформляют в виде таблицы:
№ фракции | Оптическая плотность при 540 нм | Оптическая плотность при 440 нм |
1. | ||
2. | ||
3. | ||
4. | ||
5. | ||
6. | ||
7. | ||
8. | ||
9. | ||
10. |
2 График зависимости оптической плотности от объёма элюции для двух длин волн.
3. Значение Vэг = Vэр =
Контрольные вопросы
- На каком принципе основан метод гель-фильтрации?
- Назовите основные параметры колонки, используемой для хроматографии.
- Каким образом определяют такие параметры колонки, как «Обьем наружный», «Обьем внутренний»?
- От чего зависит коэффициент распределения конкретного вещества для определённого сефадекса?
Лабораторная работа №5