Типы гидролизуемых химических связей и рабочие названия

таблица 4

Тип гидролизуемой химической связи	Рабочее название фермента	класс и подкласс
Сложноэфирная Сложноэфирная фосфатная	Эстераза фосфатаза	КФ 3. 1…
гликозидная	Гликозидаза Эндогликозидаза, экзогликозидаза, дигликозидаза	КФ 3. 2. …
пептидная	Пептидаза Дипептидаза, эндопептидаза. экзопептидаза	КФ 3.4. ..

4 класс. Лиазы

Ферменты разрывают связи С-С, С-N, С-О и другие без участия воды. Этот разрыв может сопровождаться элиминированием( вода, аммиак) и образованием двойной связи. Присоединение воды, аммиака по двойной связи также происходит с участием лиаз.

Ферменты могут быть белками простыми и сложными. Лиазные реакции, связанные с образованием двойных связей- обратимые , сопровождающиеся выделением СО₂ относятся к необратимым.

Номенклатура

Название составляется по схеме: субстрат- группа( удаляемая) – лиаза

Пример. А. L- Валинà( кофермент В₆ à изобутиламин + СО₂

L- Валин – карбокси- лиаза ( КФ 4.1.1.14)

Рабочее название: валиндекарбоксилаза

Б. Фумаровая кислота + Н ₂О àL - малат( яблочная кислота)

L - Малат- гидро- лиаза( КФ 4.2.1.2)

Рабочее название : фумараза

В. Фруктозо-1,6-дифосфатà( кофермент В₁ ) à

3- фосфоглицериновый альдегид + 3-фосфодиоксиацетон

D-фруктозо-1,6-дифосфат D глицеральдегид-3-фосфат лиаза.( КФ4.1.2.13)

Рабочее название :фруктозодифосфатальдолаза

В таблице 5 указаны основные типы связей, удаляемые( присоединяемые) группы и коферменты

Реакции с участием лиаз

Таблица 5

Тип связи, класс соединений	Удаляемая группа	кофермент	Рабочее название, класс, подкласс
С-С кетокислоты	СО2	В1	Декарбоксилаза 4.1…
С-С α – аминокислоты	СО2	В6	Декарбоксилаза 4.1…
С-С скелет моносахарида		В1	Альдолаза, кетолаза
С-О гидроксикислоты	Н 2О	-	Гидратаза 4.2
С-N аминокислоты амины	NH3	В6 , В12	Аммиаклиаза 4.3… ( дезаминаза)

Класс. Изомеразы

Ферменты катализируют структурные или пространственные( стерео) изменения в пределах одной молекулы. Подклассы формируются по типу изомеризации, а

Подподклассы- по типу субстрата.

Номенклатура

Название составляется по схеме: Указывают название субстрата, тип реакции изомеризации с помощью префиксов- общее название класса (изомераза).

Пример А. малеиновая кислота < = > фумаровая

Малеинат-цис-транс-изомераза (КФ.5.2.1.1)

Рабочее название: малеинатизомераза

Б. D -Глюкозо-6-фосфат < = > D- фруктозо-6-фосфат

D -Глюкозо-6-фосфат кетол-изомераза( КФ. 5.3.1.9)

Рабочее название: Глюкозофосфатизомераза

В рабочих, . а также и в систематических названиях, в соответствии с типом реакции изомеризации они могут обозначаться как мутазы, рацемазы, эпимеразы, таутомеразы. Чтобы расшифровать смысл биохимического превращения. надо знать химический смысл терминов, которые подробно изучались в курсе биоорганической химии.

Изомеризация углеродного скелета происходит в присутствии кофермента- витамина

В_12., перенос аминогруппы- коферменты В _6.

Пример. МетилмалонилКоА à кофермент В₁₂ à СукцинилКоА

Систематическое и рабочее названия совпадают: МетилмалонилКоА-рацемаза.

( КФ. 5.1.99.1)

Класс. Лигазы( синтетазы)

Катализируют реакции соединения молекул, процесс сопряжен с гидролизом макроэргической связи ( АТФ, ГТФ и другие аналогичные соединения)

Номенклатура

Название составляется по схеме:

Вещество(1) : Вещество(2) лигаза( указывают тип распада макроэргического соединения)

Лигазы осуществляют реакции: присоединение СО_{2 ,} аммиака, аминокислот к тРНК,

карбоновых кислот к HS -КоА , восстановление связей в нуклеиновых

кислотах - присоединение нуклеотидов - репарация ( таблица 6)

Пример Пируват + CО₂ + АТФ + Н₂ О = оксалоацетат + АДФ + ортофосфат

Пируват : оксид углерода( 1V) лигаза( образующая АДФ)

Рабочее название: Пируваткарбоксилаза

Лигазные реакции

Таблица 6

Тип связи	Присоединяемая группа	кофермент	Рабочее название	Класс, подкласс
С-С	СО2	Биотин (переносчик СО2 )	карбоксилаза	6. 4 ..
С - N	NH3 , аминокислота		синтетаза	6. 3…
С- S	HS -КоА		синтетаза	6.2 ..
Восстановление фосфодиэфирных связей	нуклеотид		синтетаза	6.5..
С-О, образование ацилтРНК	Аминокислота		синтетаза	6.1.