Последний бухарский эмир Сейид Алим-хан в 1915 году пожертвовал 1 млн рублей России на нужды Первой мировой войны.
1500-1785 Бухарское ханство.
Создание Бухарского ханства связывают с приходом к власти династии Шейбанидов в 1500 году, когда их лидер Шейбани-хан включил в состав своего государства владения тимуридов Мавераннахр и Хорасан. Однако на самом деле столицей его государства оставался Самарканд. Лишь после прихода к власти его племянника Убайдулла-хана, в 1533 году столица была перенесена в Бухару. Со второй четверти XVI века государство стало именоваться Бухарским ханством.
При Шейбанидах (1500—1599) и наследовавших им Аштарханидах (1601—1756) история Бухарского ханства представляет собой сочетание периодов спокойствия и войн, которые вели владетели Бухары с государством Сефевидов и Хорезмом.
Основатель династии Шейбаниды — Мухаммед Шейбани (1451—1510), сын Шахбудаг-султана, внук Абулхайра. Мухаммед Шейбани, собрав оставшееся ему верным войско, в 1499 году пошёл в поход на юг, в Мавераннахр и завоевал государство Тимуридов, раздробленное после смерти Тамерлана. В 1510 Шейбани-хан был разбит под Мервом иранским шахом Исмаилом I Сефевидом и убит.
Его племянник Убайдулла-хан перенёс в 1533 году столицу своего государства в Бухару. С этого времени государство Шейбанидов, так называют Бухарское ханство. Кочевые дешт-и-кипчакские племена, ушедшие с шейбанидами, нашли в Мавераннахре местное осёдлое население, тюрков, карлуков, рода кипчаков, мингов, кунгратов, меркитов, дуглатов и принесли, как победители, новому народу своё название — узбеки (что в перводе с тюркского означает «сам себе бек», «сам себе господин»). Древнетюркский карлукский язык (чагатайское наречие в монгольские времена) также смешался с внесёнными кочевыми тюркскими диалектами.
После смерти сына дочери тимурида Улугбека Кучкунджи-хана (правил в 1510-30), дяди Шейбани-хана, и кратковременного правления его сына Абу Саид-хана (1530-33) главой государства стал Убайдулла-хан (правил в 1533-40), племянник Шейбани-хана. Шейбаниды считали, что именно они являются законными наследниками Тимуридов, и вели постоянную борьбу с Сефевидами за Хорасан и вторую столицу Тимуридов — Герат. Правление Абдуллы-хана II (1557-98, хан всех узбеков с 1583 года характеризовалось значительным усилением ханской власти. После смерти Абдуллы-хана II и убийства его сына Абдалмумин-хана династия Шейбаниды прекратилась. Пирмухаммед-хану II, последнему Шейбаниду, принадлежала лишь небольшая часть государства; в 1601 году он погиб в междоусобной борьбе.
Из Шейбанидов в особенности замечателен Абдулла-хан II, ревностно заботившийся о процветании и счастье своего народа. Правитель этот в течение своего более чем сорокалетнего царствования построил множество учебных заведений, мечетей, бань, караван-сараев и мостов, развел тенистые сады в главных городах ханства, устроил почтовое сообщение, и вообще был усердным покровителем земледелия, торговли и науки. Имя Абдуллах-хана и поныне пользуется необыкновенной популярностью в Бухаре; в глазах бухарца каждый памятник прежних времён кажется результатом щедрости и любви к изящным искусствам этого правителя. Правление Шейбанидов ознаменовалось также постепенным обособлением восточно-исламского мира от западного и необыкновенным возвышением власти и влияния учёных мулл и богословов, вследствие чего богословские науки заняли в медресе Бухары первое место.
Аштарханиды, Джаниды, династия ханов Бухары 1601—1753, происходившая от астраханских ханов из дома Джучи. Пришла на смену династии в Шейбанидов в Бухарском ханстве. Наиболее известным аштарханидом был Имамкули-хан (1611-1642), при правлении которого губернатором Самарканда Ялангтушем бахадуром было завершено строительство архитектурного комплекса Регистан. Ослабление Бухарского ханства происходит при правлении последних аштарханидов Убайдулла-хана II (1701-1711) и Абулфейз-хана (1711-1747). В результате к власти в Бухаре пришла узбекская династия мангытов в лице Мухаммад Рахим-хана.
Аштарханидов сменила династия Мангыт (боковая ветвь, по женской линии, Джучи, сына Чингисхана), члены которой правили Бухарой до революции в России.
Начало усиления политического влияния представителей мангытской аристократии в Бухарском ханстве относится к началу XVII века. Но реальный рост их могущества произошел после назначения в 1712 году Худаяр-бия мангыта на пост аталыка. Его сын Мухаммад Хаким-бий занял пост диванбеги при дворе Абулфейз-хана. В 1715—1716 гг. Худаяр-бий был отстранен от должности по инициативе Ибрахима-парваначи из рода кенегесов. В 1719—1720 гг. после бегства Ибрахим-бия из Бухары Худаяр-бию, который находился в Балхе, разрешили вернуться к власти, дав ему в удел Карши, что было результатом политики его сына Хаким-бия. В 1721 году Хаким-бий был назначен аталыком.
Во время похода правителя Ирана Надир-шаха Афшара в Мавераннахр в 1740 году Мухаммад Хаким-бий пошел на мирные переговоры с ним, сохранив, таким образом, страну от войны и усилив свою власть. У него было пять сыновей: Мухаммад Бадал-бий, Курбан-мирахур (погиб в 1733), Мухаммад Рахимбий, Йав Кашти-бий, Барат-мирахур. Его третий сын — Мухаммад Рахим-бий присоединился к Надир-шаху и участвовал в его дальнейших походах.
В 1747 году после убийства Абулфейз-хана фактическая власть полностью оказалась в руках Мухаммад Рахимбия. До 1756 года номинальными правителями являлись преемники Абулфейз-хана Абдал-мумин (1747—1751), Убайдаллах II (1751—1754) и Ширгази (1754—1756). Сам Мухаммад Рахимбий женился на дочери Абулфейз-хана. Под властью Бухарского ханства при Рахим-бие находились Бухара, Самарканд, Миянкаль, Кермине, Карши, Хузар, Керки, Чарджоу, Шахрисабз. Хисар и Ташкент оставались самостоятельными владениями. Хотя Мухаммад Рахимхан не был потомком Чингисхана, он путем жесткой политики и хорошей организации смог добиться признания своей власти, взойти на трон и даже принять титул хана.