Химический состав и физическая структура вирусов
Вирусы — облигатные внутриклеточные паразиты животных, растений, насекомых, бактерий, грибов, простейших и других живых существ. Это неклеточные формы жизни, обладающие собственным геномом и способные к воспроизведению лишь в клетках более высокоорганизованных существ. Они имеют две формы жизни: внеклеточную, или покоящуюся, и внутриклеточную, размножающуюся (репродуцирующуюся), или вегетативную. Синонимами внеклеточной формы являются: «вирусная частица», «вирусный корпускул», «вирион», синонимом внутриклеточной формы — «комплекс вирус — клетка».
Единица массы. Масса вирионов и их компонентов — нуклеиновых кислот, белков, липидов, углеводов — измеряется в далътонах (Д). Для удобства используются производные от дальтона единицы — килодальтон (кД), мега-дальтон (МД), миллидальтон (мД): 1 Д=1,67´10-24 г; 1 кД=1000 Д; 1 МД=1000 кД=106 Д, 1 мД=10-3 Д.
Мол. масса нуклеиновых кислот большинства вирусов, имеющих односпиральную РНК, лежит в пределах 2—4 МД, у вирусов, имеющих двуспиральную РНК, она достигает 15 МД. Мол. масса нуклеиновых кислот ДНК-содержащих вирусов колеблется в более широких пределах — от 1,5—2 МД у парвовирусов до 160—180 МД у поксовирусов.
Единица длины. Вирусы из-за небольшого размера обычно измерялись в миллимикронах (ммк), но принятая Международная система единиц (СИ) ввела альтернативные методы измерения. По этой системе микрон теперь называется микрометром (мкм), миллимикрон — нанометром (нм). Некоторые ученые для измерения очень маленьких структур, таких, как капсомеры вируса, используют в качестве единицы измерения ангстрем (А, или АИ). Отношения между этими единицами длины следующие: 1 мкм=10-6 м; 1 нм=10-9 м; 1 мм=1000 микрометрам (мкм); 1 мкм=1000 нанометрам (нм); 1 нм=10 ангстремам (А, или АИ).
Химический состав вирусов
Вирионы просто организованных вирусов представляют собой вирусную нуклеиновую кислоту, заключенную в оболочку (капсид) из повторяющихся субъединиц (капсомеров). Каждый капсомер построен из одного или нескольких белков, закодированных в геноме вируса. Кроме нуклеиновой кислоты и белков они содержат липиды и гликолипиды, которые обычно располагаются в наружной (суперкапсидной) оболочке вирионов. В состав последних часто входят гликопротеиды (гликозилированные белки, к полипептидным цепям которых ковалентно присоединены углеводные цепи), липопротеиды, чаще всего ацилированные белки (белки, к полипептидным цепям которых ковалентно присоединены остатки жирных кислот) и фосфопротеиды (белки, к полипептидным цепям которых ковалентно присоединены остатки фосфорной кислоты). Обычно липиды и гликолипиды клеточного происхождения, за исключением, возможно, поксвирусов. Липиды не всегда расположены в наружной оболочке вириона.
Углеводы, входящие в состав вирусных белков, представляют собой полимерные цепи, синтезируемые из мономерных звеньев, поставляемых клеткой причем, у поксвирусов структура олигосахаридных цепей зависит от структуры белка, к которому они присоединены.
Присоединение к вирусным белкам остатков фосфорной и жирных кислот и углеводных цепей осуществляется, как правило, клеточными ферментами, но специфичность присоединения зависит от структуры белка.
1. Нуклеиновые кислоты представляют собой линейные полимеры, состоящие из нуклеотидов.
2. Нуклеотиды состоят из трех частей: остатка фосфорной кислоты, углеводного остатка (дезоксирибозы для ДНК, рибозы для РНК) и азотистого основания.
3. В состав ДНК обычно входят азотистые основания тимин, аденин, гуанин и цитозин.
4. В состав РНК обычно входят уридин, аденин, гуанин, цитозин.
Разнообразие структуры нуклеиновых кислот обусловлено различным порядком чередования в их цепях нуклеотидов.
5. ДНК представляет собой двунитчатую молекулу, РНК — однонитчатую.
6. Двуспиральная ДНК — это клеточный геном, выполняющий функции хранения и репликации наследственной информации. Односпиральная РНК представлена тремя классами молекул: 1) информационные РНК, (иРНК), образующиеся в результате транскрипции генома и передающие в геноме информацию на белоксинтезирующий аппарат клетки; 2) рибосомальные РНК, являющиеся структурным элементом рибосомы; 3) тРНК, доставляющие аминокислоты к белоксинтезирующему аппарату.
7. Нуклеотиды различаются по структуре углеводного остатка. Так, в состав РНК входит пятиуглеродный сахар — рибоза, а в состав ДНК —другой сахар—дезоксирибоза.
8. Нуклеотиды, а следовательно, и содержащие их нуклеиновые кислоты отличаются друг от друга еще и по строению органических оснований. Так, обычно в состав ДНК входят следующие четыре основания: аденин (А), гуанин (Г), тимин (Т) и цитозин (Ц), а в состав РНК— аденин (А), гуанин (Г), урацил (У) и цитозин (Ц).
9. В 1950 г. американский биохимик Э. Чаргафф определил, что независимо от происхождения двуспиральных ДНК содержание в них аденина всегда равно содержанию тимина (А-Т, или А:Т=1), а гуанина—содержанию цитозина (Г-Ц, или Г:Ц=1). Отсюда следовало, что сумма А и Ц равна сумме Г а Т, или (Г+Т):(А+Ц) = 1. Эти соотношения получили в дальнейшем название правил Чаргаффа. Правила Чаргаффа не распространены на односпиральные ДНК. При анализе другого типа нуклеиновой кислоты — РНК (тоже различного происхождения) указанных закономерностей не наблюдалось.
10. ДНК обычно построена из двух полинуклеотидных цепочек, закрученных спиралевидно одна вокруг другой. Основной углеводно-фосфатный костяк обеих цепочек ДНК расположен снаружи спирали, а органические основания — внутри нее, друг против друга. Обе цепочки ДНК удерживаются водородными связями между парами оснований А—Т и Г—Ц, Только при соединении двух бициклических молекул оснований (А и Г) с однокольцевыми (Т и Ц) может соблюдаться одинаковое расстояние между цепями. Такое пространственное соответствие пар оснований (А—Т и Г—Ц) называется комплементарностью. Благодаря комплементарному построению обе нити ДНК становятся взаимнооднозначными. Последовательность оснований в одной цепи однозначно определяет их последовательность в другой. Поэтому, зная расположение оснований в одной нити, можно построить на основании закона комплементарности вторую нить и наоборот:
Отсюда следует, что биологический «смысл» этих цепей различен: белки, если бы они синтезировались согласно генетической информации, заключенной в этих цепях ДНК, были бы различны и имели различную последовательность аминокислот. У вирусных геномов обе цепи используются для кодирования белков.