Три источника энергии у бактерий
По типу питания бактерии разделяют на две группы: автотрофы и гетеротрофы
Автотрофы:
1. Энергия солнечного света (фототрофы - усваивают СО2 )
2. Энергия химических связей (хемотрофы –окисление неорганических веществ, литотрофы)
Гетеротрофы
3. Энергия химических связей (органотрофы – расщепление органических веществ)
Типы дыхания бактерий
Дыхание (или биологическое окисление) — это сложный процесс, который сопровождается выделением энергии, необходимой микроорганизмам для синтеза различных органических соединений. Бактерии, как и высшие животные, для дыхания используют кислород. Однако Л. Пастером было доказано существование таких бактерий, для которых наличие свободного кислорода является губительным, энергия, необходимая для жизнедеятельности, получается ими в процессе брожения.
Все бактерии по типу дыхания подразделяются на облигатные аэробы, микроаэрофилы, факультативные анаэробы, облигатные анаэробы.
Облигатные (строгие) аэробы развиваются при наличии в атмосфере 20% кислорода (микобактерии туберкулеза), содержат ферменты, с помощью которых осуществляется перенос водорода от окисляемого субстрата к кислороду воздуха.
Микроаэрофилы нуждаются в значительно меньшем количестве кислорода, и его высокая концентрация хотя и не убивает бактерии, но задерживает их рост (актиноисцеты, бруцеллы, лептоспиры).
Факультативные анаэробы могут размножаться как в присутствии, так и в отсутствие кислорода (большинство патогенных и сапрофитных микробов — возбудители брюшного тифа, паратифов, кишечная палочка).
Облигатные анаэробы — бактерии, для которых наличие молекулярного кислорода является губительным (клостридии столбняка, ботулизма).
Аэробные бактерии в процессе дыхания окисляют различные органические вещества (углеводы, белки, жиры, спирты, органические кислоты и пр.).
Дыхание у анаэробов происходит путем ферментации субстрата с образованием небольшого количества энергии. Процессы разложения органических веществ в безкислородных условиях, сопровождающиеся выделением энергии, называют брожением. В зависимости от участия определенных механизмов различают следующие виды брожения: спиртовое, осуществляемое дрожжами, молочно-кислое, вызываемое молочно-кислыми бактериями, масляно-кислое и пр.
С выделением большого количества тепла при дыхании некоторых микроорганизмов связаны процессы самовозгорания торфа, навоза, влажного сена и хлопка.
Направление движения бактерий
· Жгутики при плавании собираются в пучок и начинают вращаться против часовой стрелки.
· Затем происходит пробег бактерии, после чего жгутики начинают вращаться по часовой стрелке.
· При этом бактерия совершает небольшой кувырок.
· Направление движения – случайное.
· Частота кувырков и пробегов будет одинаковой, если условия среды не меняются.
· При изменении условий среды меняются параметры движения.
Кинез– реакция, проявляющаяся в изменении скорости плавания. Траектория кинеза – ломанная линия
Таксисы бактерий
· Плавание с определенной целью – поиск питательных субстратов или избегание действия неблагоприятных факторов.
· Целенаправленное передвижение - способность к таксису.
· Плыть в направлении более благоприятных условий – положительный таксис.
· Избегать неблагоприятных условий – отрицательный таксис.
· Таксис – ориентированное движение МО в направлении к аттрактанту и удаление от репеллента.
Разновидности таксисов
· 1. хемотаксис – реакция на изменение концентрации растворенных веществ
· 2. аэротаксис - кислорода
· 3. осмотаксис - осмолярности
· 4. фототаксис - освещенности
· 5. термотаксис - температуры
· 6. тигмотаксис – механического воздействия
· 7. гальванотаксис – электрического тока
· 8. магнитотаксис – магнитного поля
Этапы биосинтеза белка
Биосинтез белка происходит в два этапа. В первый этап входит транскрипция и процессинг РНК, второй этап включает трансляцию. Во время транскрипции фермент РНК-полимераза синтезирует молекулу РНК, комплементарную последовательности соответствующего гена (участка ДНК). Терминатор в последовательности нуклеотидов ДНК определяет, в какой момент транскрипция прекратится. В ходе ряда последовательных стадий процессинга из мРНК удаляются некоторые фрагменты, и редко происходит редактирование нуклеотидных последовательностей. После синтеза РНК на матрице ДНК происходит транспортировка молекул РНК в цитоплазму. В процессе трансляции информация, записанная в последовательности нуклеотидов, переводится в последовательность остатков аминокислот.
Процессинг РНК
Между транскрипцией и трансляцией молекула мРНК претерпевает ряд последовательных изменений, которые обеспечивают созревание функционирующей матрицы для синтеза полипептидной цепочки. К 5΄-концу присоединяется кэп, а к 3΄-концу поли-А хвост, который увеличивает длительность жизни иРНК. С появлением процессинга в эукариотической клетке стало возможно комбинирование экзонов гена для получения большего разнообразия белков, кодируемых единой последовательностью нуклеотидов ДНК, — альтернативный сплайсинг.
Трансляция
У прокариот мРНК может считываться рибосомами в аминокислотную последовательность белков сразу после транскрипции, а у эукариот она транспортируется из ядра в цитоплазму, где находятся рибосомы. Скорость синтеза белков выше у прокариот и может достигать 20 аминокислот в секунду[1]. Процесс синтеза белка на основе молекулы мРНК называется трансляцией.
Рибосома содержит 2 функциональных участка для взаимодействия с тРНК: аминоацильный (акцепторный) и пептидильный (донорный). Аминоацил-тРНК попадает в акцепторный участок рибосомы и взаимодействует с образованием водородных связей между триплетами кодона и антикодона. После образования водородных связей система продвигается на 1 кодон и оказывается в донорном участке. Одновременно в освободившемся акцепторном участке оказывается новый кодон, и к нему присоединяется соответствующий аминоацил-т-РНК.
Во время начальной стадии биосинтеза белков, инициации, обычно метиониновый кодон узнаётся малой субъединицей рибосомы, к которой при помощи белковых факторов инициации присоединена метиониновая транспортная РНК (тРНК). После узнавания стартового кодона к малой субъединице присоединяется большая субъединица и начинается вторая стадия трансляции — элонгация. При каждом движении рибосомы от 5' к 3' концу мРНК считывается один кодон путём образования водородных связей между тремя нуклеотидами (кодоном) мРНК и комплементарным ему антикодоном транспортной РНК, к которой присоединена соответствующая аминокислота. Синтез пептидной связи катализируется рибосомальной РНК (рРНК), образующей пептидилтрансферазный центр рибосомы. Рибосомальная РНК катализирует образование пептидной связи между последней аминокислотой растущего пептида и аминокислотой, присоединённой к тРНК, позиционируя атомы азота и углерода в положении, благоприятном для прохождения реакции. Ферменты аминоацил-тРНК-синтетазы присоединяют аминокислоты к их тРНК. Третья и последняя стадия трансляции, терминация, происходит при достижении рибосомой стоп-кодона, после чего белковые факторы терминации гидролизуют последнюю тРНК от белка, прекращая его синтез. Таким образом, в рибосомах белки всегда синтезируются от N- к C-концу.
Ферменты микроорганизмов
• Энзимы– специфические белки, которые катализируют химические реакции.
• Классификация ферментов бактерий:
1. По типу катализируемой реакции – оксиредуктазы, лиазы, трасферазы, гидролазы и т.д.
2. По локализации – эндоферменты – катализируют реакции внутри клетки. Экзоферменты – выделяются из бактериальной клетки, катализируют расщепление
3. Генетический контроль образования – конститутивные (в течение всего жизненного цикла, не влияет наличие субстрата), индуцибильные – они образуются в ответ на наличие субстрата
4. По субстрату – протеолитические – расщепляют белки, сахаролитические – расщепляют углеводы, липолитические – расщепляющие жиры.
Протеазы
· расщепляют белки до аминокислот, мочевины, индола, сероводорода, аммиака. По выделению этих продуктов на средах с белком выявляют наличие протеаз.
Среды:
· С желатином – разжижение среды
· На свернутой сыворотке - по ее разжижению
· На молоке - по его просветлению
· Казеин – будет разрушаться, белок свертываться.
· На МПБ по выделению газа индола и сероводорода, которые выявляют с помощью индикаторных бумажек.
Сахаролитические ферменты
· расщепляющие углеводы
· Эти ферменты расщепляют углеводы до альдегидов, кислот, углекислого газа и H2.
· Для их определения используют МПБ или МПА, к которым добавляют индикатор кислотообразования + углевод + поплавок для газообразования.
· Пример - среды Гисса. Если свет среды меняется, выделяется газ, значит идет расщепление углеводов (моносахара).
· На этом принципе создаются панели, планшеты, бумажные индикаторные системы и приборы для учета ферментативной активности.
Липолитические ферменты
липазы – выявляют на ЖСА – желточно-солевой агар, который содержит желток - разрушение липидов желтка сопровождается помутнением среды