Последовательность сходства известных фаги генов устойчивости
ДНК-секвенирования в ПЦР-реакции, усиливаются Ген-фрагменты
более 97 до 100% - ное Совпадение с показало положили в базах данных за
Записи. Например, PCR-продукта, признаками abiM служит, 650 ВР
дня. Таким образом, 76,6% 849 ВР длинного кодирования закончатся выбранной последовательности. Которые
Последовательный анализ показывает воспроизводимые 16 замененные баз. Что соответствует 97,4% - ный
Идентичность на уровне ДНК. Сравнение аминокислотных последовательностей показывает, что 3 из
обменялись базами привести к молчащей мутации. 8 вызвать мутации
Обмен аминокислот с подобными функциональных групп, таких как валин против
Изолейцин. Остальные 5 мутаций приводят к гравировать их Изменения в
Аминокислотной последовательности. Будут ли эти изменения положительными или отрицательными на
Работоспособность фаги повлиять на устойчивость механизма, можно только экспериментально
будут уточнены.
При анализе исходной культуры Probat 8/0 и их брожений вступил в abiP-PCR
вместо 625 bp-фрагмент 830 bp длинная ПЦР-продукта. В Бременском Страна-Творог
эти два ПЦР были идентифицированы фрагменты в том же образце. Обе Банды
были вырезаны из геля и секвенированы. Это 625 bp-фрагмент показывает на ДНК
Уровне 96,2% идентичность Последовательности относительно опорной последовательности U90222 в базе данных (et Schouler
al., 1998a). Изменение нуклеотидной последовательности приводит к замене 7 аминокислот.
Что представляет собой процент от 3,6% (рис. 9). Созданный Primer несколько усиливаются
Итак, Ген abiP.
Последовательность анализа большого ПЦР-Фрагмента включает 828 оснований. Первые 138 баз
91,3%, последние 300 баз 95,7% идентичности Последовательности показывают по известным из литературы
Последовательности. Между ними 390 оснований длинный диапазон, никакого Сходства лежит в
Баз данных депонированных последовательностей имеет. С 147 между базами-это
| Page 65 |
3. Результаты
_____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
залуживали зонах см. раздел в Последовательности 625-bp-фрагмент значительно короче. Как
Рис. 9 показывает, остаются на уровне ДНК обнаруженной гомологии в области
Аминокислотной последовательности. Две области с высокой последовательности сходство мудрецов 17
договорная менял на аминокислоты, что соответствует 11,5%. Из 828 bp-фрагмент
полученный белок будет состоять из 325 аминокислот и будет на 33% больше, чем из
из литературы известен AbiP-белка.
Рис. 9. Сравнение аминокислотной последовательности из литературы известны фаги сопротивления
mechanismuses AbiP из Бременских страна-творог изолированных последовательностей.
Фаги резистентности в брожений с различной раздражающий
Из 3.2.1 вытекает, что стартовые культуры Probat 8/0 Ген сопротивления для защиты
Фаги адсорбции, 8 генов для ограничения на фаги ДНК и 8 генов созревания
и выпуск фаги предотвратить, содержит. При этих брожений стартовая культура
количество различных фаги генов резистентности в ходе скисанием был
по сравнению. Гены для адсорбции, устойчивости, рестрикционных ферментов LldI, Lla1403,
LlaII, LlaB I, LlaD I и Авива произошли во время брожений в значительной
Объемы на. Гены scrF, llaB II, llaC I, abiC, abiG1, abiG2, abiH, abiK, abiM и АБИН
играли на всех брожений второстепенную роль и были в максимум 5%
исследованные изоляты одного забора временени доказана.
| Page 66 |
3. Результаты
_____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
Объявления
Lld I
Lla1403
Lla II
LlaB I
LlaD
II
Авива
Брожения с
Нарушается окисление
Labtank
% d
Он u
Ntersu
Хотите
Изоляты
Фаги гены устойчивости
Стартовая культура
Probat 8/0
Брожения с
Непрерывное окисление
Кислота будильник
Labtank
После мрачной проявилась во время брожений с непрерывным pH-понижение
в сравнении с исходной культуры неизменное или повышенное количество
Фаги Генов Устойчивости (Рис. 10). Данное увеличение произошло в фаги свободной кислоты и будильник
фаги на загрязненных Labtank. При ферментации с неравномерным мрачной истории
гораздо меньше фаги гены устойчивости были при pH 4,7 присутствует в качестве стартовой культуры.
Рис. 10. Фаги гены резистентности после брожений с нормальным или нарушенным скисанием.
При нормальном säuernden брожения все фаги гены резистентности происходят в высших
Процентах на, чем при ферментации с замедленным скисанием. Сравнение с рис.
11 и рис. 12 показано, что адсорбция резистентности у двух брожений при рН
Значение 5,8 около 65% Lactococcusштаммов присутствовал. При хорошем
Ферментации на этот процент вырос в ходе дальнейшего окисление на 81%, в то время как он
при нарушении окисление ослабела. Аналогичная история была с llaII и у "Абортивной
Infection of Phages"-Gen Авива наблюдать, что при рН 5,8 в 66.
70% изолятов. После плохого скисанием еще только 38% состояли из
исследованных штаммов Ген, при равномерной скисанием % на комплект остался
его высокий уровень.
| Page 67 |
3. Результаты
_____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
Объявления
Lld I
Lla1403
Lla II
LlaB I
LlaD
II
Авива
%
Из untersu
ch
Ten изолятов
Фаги гены устойчивости
pH 5.8
pH 4.7
Объявления
Lld I
Lla1403
Lla II
LlaB I
LlaD
II
Авива
pH 5.8
pH 4.7
%
Обследованных
Изоляты
Фаги гены устойчивости
Рис. 11. Фаги генов резистентности в норме säuernden брожения в Labtank.
Рис. 12. Фаги генов резистентности в Labtank брожения с нарушением скисанием.
| Page 68 |
3. Результаты
_____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
Процент генов резистентности lldI, lla1403 и llaB I лежал при постоянной
säuernden брожения минимум на 20% выше, чем при брожении с задержкой
Скисанием. Ген сопротивления llaD II был независимо от рН-журнал для всех
Брожений в 18-29% исследованных изолятов существует.