Деление царства прокариот на высшие таксоны. Характеристика отделов
Предложенная в Определителе схема деления царства прокариота на высшие таксоны предусматривает наличие 4 отделов. В основу деление на отделы положено строение клеточной стенки. 1 отдел - Gracilicutes (тонкокожистые) подразделяется на три класса, объединяющие нефотосинтезирующие и фотосинтезирующие грамотрицательные организмы. 2 отдел - Firmicutes (прочнокожистые) включают 2 класса: грамположительные кокки, палочки, неветвящиеся нити и ветвящиеся формы. 3 отдел – Tenericutes (мягкокожистые) представлены одним классом – грамотрицательные прокариоты, у которых отсутствует клеточная стенка. 4 отдел – Mendosiccutes (ошибочнокожистые) представлены грамотрицательными или грамположительными организмами, объединенными в один класс как архебактерии. Ниже следует краткая характеристика микроорганизмов согласно девятому изданию определителя.
1. Грамотрицателыные эубактерии, имеющие клеточные стенки
Прокариоты со сложным (грамотрицательного типа) строением клеточных стенок. Стенки состоят из наружной мембраны, тонкого внутреннего слоя пептидогликана и дополнительно различных других компонентов снаружи или между этими двумя слоями. Клетки могут быть сферической или овальной формы, в виде прямых или изогнутых палочек, спиралей либо нитей; некоторые из этих форм могут быть окружены чехлом или капсулой. Размножение происходит путем бинарного деления, однако для некоторых групп характерно почкование и у редких организмов (Pleurocapsales) имеет место множественное деление. Миксобактерии могут образовывать плодовые тела и миксоспоры. Возможна подвижность — «плавание», скользящее движение — либо неспособность к движению. В эту категорию входят фототрофы и нефототрофы (как литотрофы, так и гетеротрофы); среди них известны аэробы, анаэробы, факультативные анаэробы и микроаэрофилы. Некоторые представители — облигатные внутриклеточные паразиты.
II. Грамположительные эубактерии, имеющие клеточные стенки
Прокариоты с клеточными стенками грамположительного типа. Форма клеток может быть сферической, палочковидной или нитевидной; палочки и нити могут быть неветвящимися, но у многих организмов имеется настоящее ветвление. Размножение обычно происходит путем бинарного деления; некоторые представители образуют споры в качестве покоящихся форм (эндоспоры или споры на гифах). Нефотосинтезирующие организмы; обычно это хемосинтезирующие гетеротрофы, среди которых есть аэробы, анаэробы, факультативные анаэробы и микроаэрофилы. К этой категории относятся простые аспорогенные и спорообразующие бактерии, а также актиномицеты и родственные им организмы.
III. Эубактерии, лишенные клеточных стенок
Прокариоты, лишенные клеточных стенок (обычно называемые микоплазмами и включающие класс Mollicutes) и не способные к синтезу молекул — предшественников пептидогликанов. Клетки окружены элементарной мембраной (плазматическая мембрана). Клетки в высокой степени плеоморфные и варьируют по размерам от крупных бесформенных везикул до очень мелких (0,2 мкм) фильтрующихся элементов. Обычны нитчатые ветвящиеся формы. Размножение может происходить путем почкования, фрагментации и/или бинарного деления. Обычно это неподвижные организмы, однако для некоторых видов характерна способность к скользящему движению. Покоящиеся формы неизвестны. По Граму окрашиваются отрицательно. Большинство нуждается для роста в питательных средах сложного состава (среды с высоким осмотическим давлением) и имеют тенденцию проникать вглубь плотной среды, образуя характерные колонии вида «яичницы-глазуньи В состав мембран как у холестеролзависимых, так и у независимых от него форм при наличии этого соединения в среде входит уникальный компонент — неэтерифицированный холестерол. Среди микоплазм существуют сапрофитные, паразитические и патогенные формы; последние вызывают болезни животных, растений и культур тканей.
IV. Архебактерии
Архебактерии — это преимущественно почвенные или водные микроорганизмы, которые встречаются в анаэробных условиях или в гиперсоленых, либо гидро- и геотермально нагретых средах и, кроме того, как симбионты в пищеварительном тракте животных. В эту группу входят аэробы, анаэробы и факультативные анаэробы, способные расти как хемолитоавтотрофы, гетеротрофы или факультативные гетеротрофы. Архебактерии могут быть мезофилами или термофилами, причем некоторые виды способны расти даже при температуре выше 100°С.
Уникальная биохимическая особенность архебактерий состоит в том, что в состав липидов у них входят изопренильные эфиры глицерола. Отсутствие муреина в клеточных стенках делает архебактерии устойчивыми к р-лактамным антибиотикам. Нуклеотидные последовательности 5S-, 16S- и 23S-pPHK сильно отличаются от соответствующих последовательностей у эубактерий и эукариот.
Размножение происходит путем бинарного деления, почкования, перетяжки, фрагментации или неизвестными способами. Цвет клеточной массы может быть красным, пурпурным, розовым, оранжево-коричневым, желтым, зеленым, темно-зеленым, серым и белым.