ДНК (дезоксирибонуклеиновая кислота).
ДНК - биологический полимер, состоящий из двух полинуклеотидных цепей, закрученных одна вокруг другой в правовитковую спираль. Мономерами каждой такой цепочки являются нуклеотиды.
Нуклеотиды, входящие в состав ДНК, содержат пятиуглеродный сахар - дезоксирибозу, одно из азотистых оснований: аденин, гуанин, цитозин, тимин (А,Г,Ц,Т) - и остаток фосфорной кислоты. Нуклеотиды различаются между собой только по структуре азотистого основания.
Два азотистых основания относятся к классу пуринов (аденин и гуанин), а два - к пиримидинам (цитозин и тимин).
В каждой цепи нуклеотиды соединяются между собой ковалентными связями: дезоксирибоза одного нуклеотида соединяется с остатком фосфорной кислоты последующего нуклеотида. Две цепи по всей длине соединены друг с другом водородными связями, возникающими между азотистыми основаниями, входящими в состав нуклеотидов разных цепей. Особенностью структуры ДНК является то, что против азотистого основания А одной цепи лежит азотистое основание Т другой цепи, а против азотистого основания Г всегда расположено азотистое основание Ц.
Такая способность к избирательному соединению нуклеотидов, в результате чего формируюся пары А-Т и Г-Ц, называется комплементарностью. Эти пары оснований называют комплементарными основаниями (дополняющими друг друга).
Нуклеотидный состав впервые количественно проанализировал американский биохимик Эрвин Чаргафф. Он обнаружил, что у всех изученных им видов количество пуринового основания аденина равно количеству пиримидинового основания тимина, т.е. А = Т. Сходным образом количество второго пурина - гуанина всегда равно количеству второго пиримидина - цитозина, т.е. Г = Ц.
Таким образом в любых молекулах ДНК сумма пуриновых оснований (А+Г) всегда равна сумме пиримидиновых (Ц+Т), причем количество аденина = количеству тимина (А=Т), а количество гуанина = количеству цитозина(Г=Ц).
Т.е. отношение аденин + гуанин = 1 (единице)
тимин + цитозин
Такая закономерность получила название правила Чаргаффа (1950г).
Это правило было использовано в дальнейшем при построении модели молекулы ДНК.
Модель ДНК.
Впервые представления о молекуле ДНК, как о гигантской спирали, было выдвинуто Морисом Уилкинсоном после получения экспериментальных данных. Он на основании проведенных рентгеноструктурных исследований указал, что молекула ДНК, вероятно, представляет собой спираль - гигантскую закрученную нить.
Основываясь на этих данных и данных многочисленных лабораторных опытов американский биохимик Джеймс Уотсон и английский физик Френсис Крик в 1953 году предложили трехмерную модель структуры молекулы ДНК, которая объяснила все факты, связанные с функционированием нуклеиновых кислот.
Исследуя строение молекулы ДНК эти ученые впервые установили, что она представляет собой закрученную вправо спираль, образованную двумя антипараллельными полинуклеотидными цепями. Причем сахаро-фосфатные участки нуклеотидов находятся на внешней стороне, а азотистые основания - внутри. Две цепи соединяются друг с другом водородными связями между их азотистыми основаниями по принципу комплементарности. При этом пурины одной цепи всегда образуют пару с пиримидинами другой цепи, и наоборот. Между А и Т образуются двеводородные связи, а между Г и Ц - три. Хотя водородные связи непрочные, но большое число этих связей обеспечивает прочное соединение нитей ДНК, что придает молекуле устойчивость и в тоже время сохраняет ее подвижность.
Две комплементарные цепи ДНК имеют противоположную полярность: они идут как бы во встречных направлениях, так что их концевые фосфатные группы находятся на противоположных концах двойной спирали.
Основания в молекуле ДНК располагаются так, что расстояние между парой оснований, т.е. одним пурином и одним пиримидином, постоянно и равно 0,34нм.
Диаметр двойной спирали ДНК составляет примерно 2 нм. В каждый виток (полный оборот) спирали входит 10 пар нуклеотидов, следовательно длина одного оборота ДНК равна 3,4 нм.
Такая модель полностью подтверждена экспериментально и сыграла исключительно важную роль в развитии молекулярной биологии и генетики.
Расположение нуклеотидов в цепях ДНК несет важную генетическую информацию. Порядок расположения нуклеотидов в молекулах ДНК определяет порядок расположения аминокислот в первичной структуре белка.
Большинство природных ДНК имеет двуцепочечную структуру. Исключение составляют некоторые вирусы, в составе которых обнаружены одноцепочечные ДНК, также линейные и кольцевые (в последнем случае концы молекулы ковалентно замкнуты).
В клетках прокариот ДНК представлена в виде кольца.
Биспиральная структура ДНК не является абсолютно жесткой, что делает возможным образование перегибов, петель, суперспиралей и т.п. необходимых для упаковки гигантских молекул ДНК в малом объеме клетки или вируса.
В начале пятидесятых годов Мирский и Вендрели показали, что все соматические клетки организмов одного вида содержат одинаковое количество ДНК. В половых клетках ДНК содержится (в расчете на одну клетку) вдвое меньше. Известно, что содержание ДНК в одном сперматозоиде человека равно 3,3. 10-12 г. Такое же количество ДНК содержится в яйцеклетке человека. Следовательно, в 6,6. 10-12 г ДНК содержится вся информация, определяющая развитие человека.
В молекуле ДНК различают несколько структур:
Первичная- это последовательность нуклеотидов в цепи, она строго индивидуальна и специфична для каждой природной ДНК и представляет собой закодированную запись биологической информации (генетический код). Первичная структура поддерживается сильными ковалентными связями.
Вторичная - цепи, закрученные в спираль и удерживающиеся друг около друга за счет водородных связей.
Третичная- объединение ДНК с белками-гистонами в хромосомах.
Редупликация ДНК.
Принцип комплементарности лежит в основе уникальной способности ДНК к самоудвоению (редупликации).
Для того, чтобы новые цепи ДНК были построены по принципу ко-мплементарности, двойная спираль должна быть раскручена и родительские цепи отделены друг от друга. Только в этом случае фермент ДНК-полимераза способен двигаться по "материнским" цепям и использовать их в качестве матрицы для безошибочного синтеза "дочерних" цепей.
Редупликация происходит следующим образом. Под действием специальных ферментов разрываются водородные связи между двумя цепями и происходит локальное расплетение двойной спирали, образование репликативной вилки. Затем при участии фермента ДНК-полимеразы, который передвигается вдоль материнской цепи, синтезируется новая (дочерняя) цепь ДНК по принципу комплементарности. Таким образом, каждая полинуклеотидная цепь выполняет роль матрицы для новой комплементарной цепи. В результате получаются две молекулы ДНК, у каждой из которых одна половина происходит от родительской молекулы, а другая является вновь синтезированной, т.е. две новые молекулы ДНК представляют собой точную копию исходной молекулы.
Такой механизм редупликации называют полуконсервативным, т.к. каждая дочерняя цепь сохраняет (консервирует) в неизменном виде одну из материнских цепей.