Биосинтез РНК (транскрипция).
Область связывания (специфическая последовательность ДНК) РНК-полимеразы с матрицей называется промотором. Завершается синтез, когда РНК-полимераза достигает терминирующей последовательности (сайт терминации). Участок ДНК, ограниченный промотором и сайтом терминации, представляет собой единицу транскрипции — траискриптон. У эукариотов в состав транскриптона, как правило, входит только один ген.
В процессе транскрипции различают три стадии: инициацию, элонгацию и терминацию. Активация промотора происходит с помощью белкового фактора (ТАТА-фактора), который получил свое название потому, что взаимодействует со специфической последовательностью нуклеотидов промотора ТАТА -боксом. Присоединение ТАТА-фактора облегчает взаимодействие промотора с РНК-полимеразой. Присоединение РНК-полимеразы к промотору увеличивает сродство фермента к факторам инициации (А, В), которые инициируют раскручивание примерно одного витка двойной спирали ДНК.
Факторы элонгации (Е, Н, F) повышают активность РНК-полимеразы и облегчают локальное расхождение нуклеотидных цепей. Синтез молекулы РНК идет от 5'- к З'-концу комплементарно матричной цепи ДНК. По мере продвижения РНК-полимеразы по цепи ДНК впереди нее происходит расхождение, а позади — восстановление двойной спирали.
Расхождение двойной спирали ДНК в области сайта терминации делает его доступным для фактора терминации. Транскрипция прекращается, когда РНК-полимераза достигает сайта терминации. Фактор терминации облегчает отделение первичного транскрипта от матрицы. Образованная нуклеиновая кислота комплементарна матрице.
Посттранскрипционная модификация. У эукариотов мРНК образуется из гетерогенной ядерной РНК (гяРНК-первичный транскиптат). В ядре происходит ряд ковалентных модификаций, превращающих первичный транскрипт в зрелую молекулу РНК. Модификации пре мРНК начинаются на стадии элонгации. Когда длина первичного транскрипта достигает примерно 30 нуклеотидов, происходит кэпирование его 5'-конца. Кэп – это колпачок, состоящий из метилированного в 7 положении гуанозин-5’- трифосфата. Функции кэпа: предохраняет 5’ – конец мРНК от расщепления, участвует в сплайсинге, служит для распознавания мРНК рибосомными факторами инициации. Кроме того, кэп помогает мРНК пройти ядерно-поровый комплекс.
Рисунок 3. Транскрипция
На З'-конце первичного транскрипта мРНК специальным ферментом полиА-полимеразой формируется полиА-последовательность, которая состоит из 100—200 остатков адениловой кислоты. Наличие полиА-последовательности на 3'- конце облегчает выход мРНК из ядра и замедляет ее гидролиз в цитоплазме. Молекулы тРНК и рРНК не содержат кэпа и полиА-последовательности.
Первичный транскрипт комплементарен гену, содержит как экзоны, так и нитроны. Последовательности интронов вырезаются из первичного транскрипта, концы экзонов соединяются друг с другом; такая модификация РНК называется сплайсингом. Сплайсинг происходит в ядре, в цитоплазму переносится уже зрелая мРНК .
Процесс вырезания интронов протекает при участии малых ядерных рибонуклеопротеинов (мяРНП) — сплайсосом. мяРНП состоит из малой ядерной РНК (мяРНК), цепь которой связана с белковым остовом, состоящим из нескольких протомеров. Отдельные мяРНП по принципу комплементарности «узнают» специфические последовательности интронов первичного транскрипта. мяРНП катализирует реакцию расщепления З',5'-фосфодиэфирной связи на границе экзона с интроном и последующее соединение 2 экзонов путем реакции трансэтерификации, в процессе которых свободная ОН – группа одного экзона связывается со свободным 5' – фосфатом другого экзона. Во время этих процессов весь комплекс удерживается вместе сплайсосомой.
После завершения сплайсинга зрелая мРНК становится примерно в 4 раза короче первичного транскрипта.
Таким образом, созревание мРНК включает следующие этапы:
• кэпирование 5'-конца;
• присоединение полиА-фрагмента к З'-концу;
• сплайсинг (удаление интронов).
Структура иРНК. На 5’ – конце линейной молекулы РНК имеется кэп, за ним расположена лидерная последовательность, затем кодон инициации, обычно представленный триплетом аденин-урацил-гуанин, затем следует кодирующий участок состоящий из экзонов, заканчивающийся терминирующим кодоном (урацил-гуанин-аденин; урацил-урацил-аденин; урацил-аденин-гуанин). На 3’- конце находится нетранслируемая трейлерная последовательность, затем полиадениловый хвост, состоящий из 100-200 остатков. Его функция – защита от разрушения, а также облегчает прохождение иРНК из ядра в цитоплазму.
Альтернативный сплайсинг иРНК. В некоторых случаях наблюдаются альтернативный сплайсинг и полиаденилирование, которые приводят к образованию разных белков с одного и того же первичного транскрипта. Так, в парафолликулярных клетках щитовидной железы в ходе транскрипции гена кальцитонина образуется иРНК, которая содержит информацию о гормоне белковой природы, ответственном за регуляцию обмена ионов кальция. В мозге тот же первичный транскрипт подвергается другому варианту сплайсинга и полиаденилирования, в результате чего получается мРНК, кодирующая белок, ответственный за вкусовое восприятие. Альтернативный сплайсинг описан для большого числа транскрибируемых генов.
Изменение стабильности иРНК. Полупериод жизни иРНК эукариотов составляет от нескольких часов до нескольких дней (полупериод жизни иРНК прокариотов равен нескольким минутам), и в то же время стабильность молекул иРНК является фактором, изменение которого влияет на уровень трансляции. Стабилизация иРНК при фиксированной скорости транскрипции будет приводить к ее накоплению и увеличению количества образующегося белкового продукта. Так, при лактации гормон пролактин увеличивает полупериод жизни иРНК казеина — основного белка молока.
Литература:1. Биохимия: учебник /Под ред. Е.С. Северина. – 2-е изд., испр. – М. :ГЭОТАР-МЕД, 2004.- 784 с;.2.. Биохимия. Краткий курс с упражнениями и задачами /под редакцией Е. С. Северина и А.Я. Николаева – М.:ГЭОТАР-МЕД, 2001.- 448 с. 3. Гринстейн Б., Гринстейн А. Наглядная биохимия: Пер. с англ. – М.:ГЭОТАР-МЕД, 2000.- 119 с.- («Экзамен на отлично»)