ДНК-связывающие белки, участвующие в регуляции транскрипции
В молекулярной биологии и генетики , фактор транскрипции (иногда называют последовательности конкретных ДНК -связывающего фактор) является белок , который связывается со специфическимипоследовательностями ДНК , тем самым контролируя поток (или транскрипцию ) генетической информации от ДНК к РНК . Факторы транскрипции выполнять эту функцию в одиночку или с другими белками в комплексе, путем содействия (как активатора ), или блокирование (как репрессор ) вербовку РНК-полимеразы (фермента, который выполняет транскрипцию генетической информации от ДНК РНК) в специфических генов.
Определяющей чертой транскрипционных факторов является то, что они содержат один или несколько ДНК-связывающие домены (DBDS), которые крепятся к специфических последовательностей ДНК, прилегающей к генов, которые они регулируют. Дополнительные белки, такие как коактиваторов , хроматина ремонтом , гистонов ацетилазы , деацетилазы , киназы и метилазы , в то же время играет решающую роль врегуляции генов , не хватает ДНК-связывающих доменов, и, следовательно, не подпадают под определение факторов транскрипции.
Сохранение в разных организмов
Факторы транскрипции имеют важное значение для регуляции экспрессии генов и, как следствие, найденные во всех живых организмах. Количество факторов транскрипции, найденных в организме увеличивается с размером генома, и больших геномов, как правило, имеют больше факторов транскрипции на геном.
Есть около 2600 белков в человеческом геноме , которые содержат ДНК-связывающие домены, и большинство из них, как предполагается, действовал в качестве транскрипционных факторов, хотя другие исследования показывают, что это будет меньшее количество.
Структура
Принципиальная схема аминокислотной (аминоконце к левой и карбоновой кислоты конца справа) о прототипе транскрипционного фактора, который содержит (1) в ДНК-связывающий домен ( DBD ), (2) сигнал зондирования домена ( SSD ) , и домен трансактивации ( TAD ).Порядок размещения и числа доменов могут отличаться в различных типах факторов транскрипции. Кроме того, трансактивации и сигнал зондирования функции часто содержится в том же домене.
Факторы транскрипции имеют модульную структуру и содержать следующие домены :
· ДНК-связывающий домен ( DBD ), которые придают специфических последовательностей ДНК ( энхансерили Promoter : необходимым компонентом всех векторов: используется для привода транскрипцию трансгенных вектора в промоторных последовательностей), прилегающих к регулируемых генов.Последовательности ДНК, которые связываются факторы транскрипции, часто называют чувствительными элементами .
· Транс-активации домена ( TAD ), которые содержат сайты связывания для других белков, таких кактранскрипции coregulators . Эти сайты связывания часто называют функциями активации ( AFS ).
· Дополнительный домен чувствительный сигнал ( SSD ) ( например , лиганд-связывающий домен), который воспринимает сигналы от внешних и, в ответ, передает эти сигналы на остальной части комплекса транскрипции, в результате чего вверх или вниз регуляции экспрессии генов. Кроме того, DBD и сигнал зондирования домены могут находиться на отдельных белков, которые связывают в транскрипции комплекса регулировать экспрессию генов.