В графстве Бургундия Этьену наследовал сын Рено II, а в Маконе и Вьенне сыновья Рено III и Гильом III (IV).
1125-1127 Гильом (Вильгельм) III Дитя (фр. Guillaume III l'Enfant; ок. 1110 — 1 марта 1127, Пейерн, современная Швейцария), пфальцграф Бургундии и граф Макона с 1125, сын Гильома II Немца, пфальцграфа Бургундии, и Агнесс фон Церинген, дочери герцогаБертольда II фон Церинген.
В момент гибели отца, убитого в результате заговора баронов, Гильом был ещё подростком. В результате Гильом Дитя унаследовал графства Бургундия и Макон. Но через два года он сам был убит в церкви города Пейерн (современная Швейцария) в результате заговора баронов, возглавляемым Пьером и Филиппом де Глан.
Это убийство вызвало затяжной конфликт между двоюродным братом Гильома, графом Макона и Вьена Рено III, и Конрадом фон Церинген, братом матери Гильома, которые предъявили претензии на наследство Гильома.
1102-1148 Рено III Бургундский (фр. Renaud III de Bourgogne, до 1093—1148) — пфальцграф Бургундии с 1127, граф Макона и Вьенна с1102, сын графа Бургундии Этьена I Храброго и Беатрис, дочери герцога Лотарингии Жерара (Герхарда) I. Одновременно он приходился племянником папе римскому Каликсту II. Основатель города Доль.
В 1102 году Рено в возрасте 9 лет становится графом Макона и Вьенна, унаследовав их после своего отца, умершего в Палестине во время крестового похода. В 1127 году Рено предъявил претензии на графство Бургундию, использовав в качестве предлога убийство баронами своего двоюродного племянника Гийома III Дитя. Поскольку встречные претензии предъявил также Конрад I фон Церинген (убитый граф Гийом приходился ему родным племянником по линии матери), а того поддерживал император Лотарь II, то Рено пришлось вступить в конфликт со Священной Римской империей. И если в первые годы конфликта удача сопутствовала Рено III, то после избрания в 1138 году германским королём Конрада III ситуация изменилась и окончательную победу в войне одержали Церингены. И хотя Рено смог сохранить графский титул, ему пришлось отдать часть своих территорий на востоке Юры и признать Конрада фон Церингена «ректором Бургундии». Рено неофициально называли «французским графом» (franc-comte) и, по некоторым предположениям, именно это прозвище стало топонимом региона Франш-Контэ, по другой версии император прозвал Рено III «Франш-Конте» («Свободный граф»), поскольку тот отказался принести оммаж императору и осуществлять платежи в пользу империи.
Рено III умер в 1148 году в возрасте 55 лет. Ему наследовала единственная дочь Беатрис.
1148-1184 Беатрис I (графиня Бургундии) (фр. Béatrice Ire de Bourgogne; ок.1145—15 ноября 1184), графиня Бургундии c 1148 года, императрица Священной Римской империи (после свадьбы в 1156 году с императором Фридрихом Барбароссой).
Наследовала своему отцу Рено III Бургундскому в 3-летнем возрасте. Вокруг потенциального титула пфальцграфа разгорелись нешуточные бои. Опекуном Беатрис и регентом Бургундиистал её дядя Гильом III, граф Макона, который в Бургундии носил имя Гильом IV. Желая получить графский титул, он фактически держал свою племянницу под домашним арестом. С другой стороны на Бургундию претендовал герцог Бертольд IV фон Церинген, отец которого носил титул «ректор Бургундии», полученный от императора Лотаря Суплинбургского. Претензии Бертольда IV были поддержаны императором Конрадом III и Беатрис была освобождена. Однако в конечном итоге титул пфальцграфа не достался и Церингенам. В 1156 году новый император Фридрих I Барбаросса женился на Беатрис, взяв графство Бургундиюв качестве приданого и присоединив её таким образом к владениям Гогенштауфенов.
Беатрис умерла 15 ноября 1184 года и похоронена в крипте Шпайерского собора (нем. Kaiser- und Mariendom zu Speyer) вместе со своей дочерью Агнес.
Гогенштауфены.
1156—1184 Фридрих I Барбаросса(1122—10 июня 1190), герцог Швабии (1147—1155, король Германии с 1152, король Италии 1154—1186, император Священной Римской империи с 1155, граф Бургундии (1156—1184), король Бургундии с 1178, муж Беатрисы I
1184-1200 Оттон I (нем. Otto, фр. Othon, ок. 1171 — 13 января 1200, Безансон), пфальцграф Бургундии с 1189 из династии Гогенштауфенов, 4-й сын императора Священной Римской империи Фридриха I Барбароссы и Беатрис I, графини Бургундии
Отправляясь в 1189 году в Третий крестовый поход, император Фридрих Барбаросса передал Оттону во владение графство Бургундия, унаследованное императором Фридрихом как приданое жены. Но Оттон не смог продолжать искусную политику отца в Бургундии, спровоцировав конфликт с герцогом Бургундии и графом Савойским. Зависимость графства от Священной Римской империи ослабевала, постоянно происходили столкновения с графами Савойи и Прованса. Позже Оттон впутался в борьбу с епископом Страсбурга Конрадом II и графом Монбельяра Ричардом, поскольку он пытался расширить своё влияние на Эльзас. Оттону удалось победить нескольких противников, одного он даже убил собственноручно при ведении переговоров. Но целей своих он так и не добился.
После смерти в 1196 году графа Люксембурга Генриха IV Слепого, не оставившего сыновей, император передал Люксембург Оттону. Однако граф Бара Тибо I, муж единственной дочери Генриха, Эрмезинды, договорился с Оттоном, в результате чего тот отказался от Люксембурга в пользу Эрмезинды и Тибо.