Приведите свойства ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОДА
1. | |
2. | |
3. | |
4. | |
5. | |
6. | |
7. |
ТАБЛИЦА ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОДА
Нуклеотиды: У – уридиловый, Ц – цитидиловый, Т – тимидиловый, А – адениловый, Г – гуаниловый.
Мет – триплет, кодирующий данную аминокислоту, означает и начало трансляции – синтеза полипептидной цепи.
«Стоп» – условное название кодона, определяющего окончание трансляции (синтеза полипептидной цепи).
Фен – амиинокислота фенилаланин; Про – аминокислота пролин; Лей – лейцин; Тир – тирозин; Иле – изолейцин; Цис – цистеин; Мет – метионин; Гис– гистидин; Вал – валин; Apr – аргинин; | Сер – серин; Тре – треонин; Аси – аспарагин; Ала – аланин; Асп – аспарагиновая кислота; Лиз –лизин; Гли – аминокислота глицин; Глу – глутаминовая кислота; Три – триптофан; Глн – аминокислота глутамин. |
ПОЛЬЗОВАТЬСЯ ТАБЛИЦЕЙ НУЖНО СЛЕДУЮЩИМ ОБРАЗОМ:
1) первый нуклеотид триплета берётся из левого вертикального ряда;
2) второй – из верхнего;
3) третий – из правого вертикального;
4) там, где пересекутся линии, идущие от всех трех нуклеотидов, содержится нужная аминокислота.
При решении задач, связанных с определением качественного состава нуклеиновых кислот по аминокислотной последовательности, из третьего столбца таблицы берутся верхние нуклеотиды.
Предположим, нужно выяснить, какая аминокислота кодируется кодоном УАЦ в зрелой и-РНК. Слева по вертикали берем У, сверху – А, справа по вертикали – Ц. Линии пересечения на «Тир», т.е. тирозин. В ДНК эта аминокислота закодирована триплетом АТГ (нуклеотиды ДНК записаны в скобках).
ПРАКТИЧЕСКАЯ ЧАСТЬ
ПРИМЕРЫ РЕШЕНИЯ ЗАДАЧ
ЗАДАЧА 1
В фрагменте одной цепи молекулы ДНК нуклеотиды расположены в такой последовательности: 5' ТТГ – АГЦ – АДГ – ГТА – ААТ – ЦГА 3'.
1. Постройте схему двухцепочечной ДНК.
2. Какова длина в нанометрах этого фрагмента?
3. Какова масса двухцепочечного фрагмента?
РЕШЕНИЕ
1. Используя принцип комплементарности, запишем схему двухцепочечной ДНК:
А=Т
Ц=Г
5' | ТТГ | АГЦ | АДГ | ГТА | ААТ | ЦГА | 3' |
3' | ААЦ | ТЦГ | ТГЦ | ЦАТ | ТТА | ГЦТ | 5' |
2. Каждый нуклеотид занимает 0,34 нанометра. Длина двухцепочечного фрагмента равна длине одной цепи. В фрагменте 18 пар нуклеотидов, отсюда длина фрагмента ДНК равна:
0,34 × 18 = 6,12 (нм).
3. Каждый нуклеотид имеет молекулярную массу 345 (300) а.е.м., отсюда масса фрагмента ДНК:
345 × 36 = 12420 (а.е.м.).
ЗАДАЧА 2
Биохимический анализ показал, что в состав и-РНК входит 22 % адениловых нуклеотидов, 12 % уридиловых и 26 % гуаниловых. Определите нуклеотидный состав ДНК, с которой была транскрибирована данная и-РНК.
РЕШЕНИЕ
1. Процент цитидиловых нуклеотидов в и-РНК составляет:
100 % - (22 % + 12 % +26 %) = 40 %.
2. Молекула ДНК состоит из двух цепей, следовательно, на одну цепь приходится 50 %, т.е. в 2 раза меньше нуклеотидов. Определим состав кодирующей цепи ДНК:
и-РНК цепь ДНК
12 % У А = 12 % : 2 = 6 %
22 % А Т = 22 % : 2 = 11 %
40 % Ц Г = 40 % : 2 = 20 %
26 % Г Ц = 26 % : 2 = 13 %
Вторая цепь ДНК имеет, согласно принципу комплементарности:
А = 11 %, Т = 6 %, Г = 13 %, Ц = 20 %.
3. Следовательно, в целом в молекуле ДНК процентное содержание нуклеотидов следующее:
А = 6 %+11 %= 17 %
Т = 11 % + 6 % = 17 %
Г = 20 % + 13 % = 33 %
Ц = 13 % + 20 % = 33 %
ЗАДАЧА 3
Структурный ген (фрагмент молекулы ДНК) содержит 384 цитидиловых нуклеотида, что составляет 20 % от их общего количества. В экзонных участках этого гена закодирован белок, состоящий из 120 аминокислотных остатков.
1. Определите нуклеотидный состав гена.
2. Чему равна молекулярная масса интронных участков гена?
3. Насколько зрелая и-РНК короче про-и-РНК?
РЕШЕНИЕ
1. Определим общее число нуклеотидов в фрагменте ДНК. Так как на цитидиловые нуклеотиды приходится 20 % от общего количества, то общее количество нуклеотидов составит
384 × 100 % : 20 % = 1920 (нуклеотидов).
Число гуаниловых нуклеотидов равно числу цитидиловых, а адениловых и тимидиловых содержится по
(1920 — 384 × 2): 2 = 576 (нуклеотидов).
2. Найдем количество нуклеотидов в экзонных участках гена:
120 × 3 × 2 = 720 (нуклеотидов).
Тогда в интронных участках гена будет
1920 - 720 = 1200 (нуклеотидов).
Их молекулярная масса составляет 345 × 1200 = 414000 (а.е.м.).
3. Длина молекулы про-и-РНК равна длине структурного гена:
0,34 × 960 = 326,4 (нанометра).
Зрелая и-РНК состоит лишь из информативной части, её длина равна
0,34 × 360 = 122,4 (нанометра).
Разница в длине про-и-РНК и зрелой и-РНК составляет 326,4—122,4 = 204 (нанометра).
ЗАДАЧА 4
Определите молекулярную массу и длину гена, если в нем закодирован полипептид, молекулярная масса которого равна 28000 а.е.м. Что имеет большую массу – белок или кодирующий его ген?
РЕШЕНИЕ
1. Белок состоит из 28000:100 = 280 аминокислот.
2. Этот белок кодируется одной из цепей гена, которая содержит
280 × 3 = 840 нуклеотидов.
3. Молекулярная масса гена (состоит из двух цепей ДНК) равна
345 × 840 × 2 = 579600 (а.е.м.)
4. Длина гена равна длине одной из его цепей:
0,34 × 840 = 285,6 (нм).
5. Сравним массу гена и массу полипептида:
579600 : 28000 = 20,7
т.е. масса гена примерно в 21 раз больше.
ЗАДАЧИ ДЛЯ САМОСТОЯТЕЛЬНОГО РЕШЕНИЯ
ЗАДАЧА № 1
Одна из цепей фрагмента ДНК имеет следующую последовательность нуклеотидов:
3' | АГТ | АЦЦ | ГАТ | ЦЦТ | ЦГА | ТТТ | АЦГ | 5' |
Напишите последовательность нуклеотидов и-РНК, закодированной в данном фрагменте ДНК.
ЗАДАЧА № 2
Кодирующая зона участка и-РНК имеет следующую последовательность нуклеотидов:
5' | АУГ | УЦА | АГГ | ЦУА | АГЦ | УУУ | ГЦЦ | ААУ | УАА | 3' |
1. Напишите первичную структуру полипептида, закодированную в данном фрагменте и-РНК.
2. Укажите порядок соединения аминокислотных остатков.
ЗАДАЧА № 3
В одной из цепей фрагмента ДНК нуклеотиды расположены в следующем порядке:
5' | ЦЦЦ | ГЦЦ | АЦЦ | ТГЦ | ГГА | 3' |
1. Напишите последовательность нуклеотидов в комплементарной цепи ДНК.
2. Укажите направление синтеза новой цепи и направление транскрипции с исходной цепи ДНК.
ЗАДАЧА № 4
Фрагмент кодирующей зоны и-РНК имеет следующий состав нуклеотидов:
5' | УАЦ | ГАЦ | ЦАГ | ГАЦ | ЦАА | УУГ | 3' |
Напишите последовательность нуклеотидов фрагмента цепи ДНК, являющейся матрицей для данной и-РНК.
ЗАДАЧА № 5
Начало цепи одной из фракций гистона Н3 (специфичного основного белка), выделенного из тимуса теленка, имеет следующую последовательность аминокислот: Ала – Арг – Тре – Лиз. Какова возможная структура соответствующих фрагментов и-РНК и двухцепочечной ДНК?
ЗАДАЧА № 6
Полипептид состоит из 10 аминокислот, расположенных в следующей последовательности: Глн – Про – Ала – Сер – Мет – Три – Асп – Гли – Асн – Гис. Определите структуру и-РНК, кодирующей данный полипептид.
ЗАДАЧА № 7
Фрагмент цепи А нормального гемоглобина состоит из 7 аминокислот, расположенных в следующем порядке: Вал – Лей – Лей – Тре – Про – Глн – Лиз. Какова структура отрезка и-РНК, служащего матрицей для синтеза этого участка молекулы гемоглобина, и соответствующего фрагмента ДНК, кодирующей данную и-РНК?
ЗАДАЧА № 8
Фрагмент молекулы адренокортикотропного гормона человека (АКТГ), вырабатываемого передней долей гипофиза, имеет структуру: Сер – Тир – Сер – Мет. Определите перечень антикодонов в т-РНК, участвующих в биосинтезе фрагмента АКТГ.
ЗАДАЧА № 9
Одна белковая молекула вируса табачной мозаики (ВТМ) состоит из 158 аминокислот. Определите, что тяжелее – молекула белка или соответствующий ген ВТМ, во сколько раз. Примите массу одной аминокислоты за 100, а массу нуклеотида за 345 а.е.м.
ЗАДАЧА № 9
Какова длина гена собаки, если он кодирует белок с молекулярной массой 3000 а.е.м.? (Масса одной аминокислоты 100, а длина одного нуклеотида 0,34 нм).
ЗАДАЧА № 10
Одна из цепей ДНК имеет молекулярную массу 119025 а.е.м. Определите количество мономеров белка, закодированного в этой цепи ДНК. Сколько времени занимает трансляция?
ЗАДАЧА № 11
Молекулярная масса белковой молекулы составляет 100000, а молекулярная масса одной аминокислоты – 100 а.е.м. Определите длину соответствующего гена, кодирующего эту белковую молекулу, если длина одного нуклеотида составляет 0,34 нм.
ЗАДАЧА № 12
Молекулярная масса белковой молекулы составляет 100000, а молекулярная масса одной аминокислоты – 100 а.е.м. Определите массу соответствующего гена, кодирующего эту белковую молекулу, если масса одного нуклеотида составляет 345 а.е.м.
ЗАДАЧА № 13
Фрагмент молекулы ДНК содержит 440 гуаниловых нуклеотидов, что составляет 22 % от общего их количества. Определите, какова масса данного фрагмента ДНК, если масса одного нуклеотида 345 а.е.м.
ЗАДАЧА № 14
В молекуле и-РНК человека в результате биохимических исследований обнаружено 440 гуаниловых нуклеотидов, 325 адениловых, 128 цитидиловых и 348 уридиловых нуклеотидов. Сколько адениловых нуклеотидов содержится в фрагменте молекулы ДНК, транскрипционной копией которой является данная и-РНК?
ЗАДАЧА № 15
Сколько аминокислот в среднем содержат белковые молекулы, если известно, что в фрагменте ДНК, имеющем массу 4 × 106 а.е.м., закодированы 4 белковые молекулы?
ЗАДАЧА № 16
Сколько аминокислот имеет в среднем белковая молекула, если в фрагменте ДНК, имеющем размер 10200 нм, закодировано 20 белковых молекул?
ЗАДАЧА № 17
Возбудитель СПИДа – ВИЧ-ретровирус, наследственная информация у него записана в РНК, состоящей из 9213 нуклеотидов. Эта РНК содержит 7 генов: 3 структурных и 4 регуляторных.
1. Перечислите основные этапы реализации наследственной информации, закодированной в РНК ВИЧ.
2. Укажите основные ферменты, катализирующие эти этапы.
3. Определите молекулярную массу регуляторных генов, если на структурные гены ВИЧ приходится 4000 нуклеотидов.
ЗАДАЧА № 18
Структурный ген фермента РНК-полимеразы включает9450пар нуклеотвдов. Известно, что РНК- полимераза состоит из 329 аминокислотных остатков. Сколько кодирующих и некодирующих нуклеотидных пар входят в состав гена РНК-полимеразы? Какова молекулярная масса зрелой и-РНК?
ЗАДАЧА № 19
Белок А – мономер, состоящий из 560 аминокислотных остатков. Ген этого белка включает 2 интрона (по 10 тыс. пар нуклеотидов), 3 экзона (каждый из которых содержит одинаковое количество пар нуклеотидов).
1. Сколько пар нуклеотидов входит в состав данного гена?
2. Сколько пар нуклеотидов входит в состав каждого экзона?
3. Сколько нуклеотидов входит в состав кодирующей зоны и-РНК данного белка?
ЗАДАЧА № 20
Белок N – димер. Каждая из его полипептидных цепей (А- и В-цепи) состоит из 250 аминокислотных остатков. Ген A-цепи включает 2 интрона, а ген В-цепи имеет 3 интрона. Каждый из интронов состоит из 3 тыс. пар нуклеотидов. Ген A-цепи содержит 3 экзона, ген В-цепи – 2 экзона.
1. Сколько пар нуклеотидов входит в состав гена A-цепи и гена В-цепи белка N?
2. Сколько нуклеотидов содержится в про-и-РНК каждой полипептидной цепи?
3. Сколько нуклеотидов содержится суммарно в зрелых и-РНК белка N?
ЗАДАЧА № 21
Оперон (совокупность структурных генов и гена-оператора) включает в себя 10800 нуклеотидов. В нем закодированы три полипептидные цепи, каждая из которых состоит из 360 аминокислотных остатков. На интронные участки структурных генов приходится 3600 нуклеотидов. Определите молекулярную массу гена-оператора.
|
____.____.20____
ЗАНЯТИЕ № 5